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…and the winner for some of the prettiest and most useful plots I’ve seen this year goes to two recent (new?) studies in Science about proteomics of mouse synapses and sleep. (One and two) I stared at the very top for several minutes in the afternoon when my brain is generally working at it’s typicalContinue reading “Synapse proteomics (and phosphoproteomics) and sleep cycle!”

The table above is a great breakdown of what I’m going to call “nextgen proteomics search engines” going forward. SeQuest (and, yes, reviewer number 3, I’m going to continue to capitalize it this way for the rest of time. Typing it in all caps makes it seem like I’m screaming about how much I missContinue reading “Why hundreds of thousands (millions) of unidentified MS signals matter!”

I’m skeptical of these results, but I still think they’re worth mentioning. This is an Exploris data dependent experiment. 80ng of commercial HeLa digest on a 60 minute gradient with different resolutions. 120k MS1 and two separate runs (n = 1, look ma’ I’m a scientist…) The 18ppm MS/MS fragment tolerance lines up with whatContinue reading “Exploris mass accuracy at highest speeds? Or is the data being read funny?”

How did I miss this?!?  We can ALL do proteogenomics if someone is nice enough to open the door by taking all the “normal variation” and deleterious mutations and put them into nice protein .FASTA databases for us. Then we just do what we’d normally do, maybe mumble something semi-coherent about FDR in the methodContinue reading “XMAN v2.0 — Even more human cancer mutations — now on Github!”

“Missing proteins” are the ones that the genetics stuff says are there that we can’t find proteomics evidence for. Both the really hydrophilic and the really hydrophobic aren’t a lot of fun to work with, particularly if you’re using things like trap columns (or cough cough PepMap). Good-bye hydrophilic peptides!  Unfortunately, those missiing proteins tendContinue reading “ProteoMiner utilized to find missing proteins!”

A Prefeitura Municipal de Quixeramobim entregou a população de Lagoa Cercada, na zona rural, mais um equipamento público na noite do último sábado, 07. Trata-se da inauguração da Praça da comunidade. “Sentimento de dever cumprindo, de que se trabalhando desta forma nós conseguimos levar os benefícios a todas as regiões”, disse o prefeito ao lembrarContinue reading “Prefeitura entrega Praça da Lagoa Cercada”

O Banco do Nordeste alcançou, nos primeiros onze meses de 2019, aplicações globais no montante de R$ 35 bilhões. Desse total, R$ 25 bilhões foram contratados com recursos do Fundo Constitucional de Financiamento do Nordeste (FNE), correspondendo a 519,3 mil operações de crédito que beneficiaram empreendimentos nos 1990 municípios  localizados na área de atuação doContinue reading “Banco do Nordeste alcança R$ 35 bilhões em aplicações este ano”

A sul-africana Zozibini Tunzi chamou atenção do júri da 68ª edição do Miss Universo, composto apenas por mulheres, em seu último discurso antes de ser coroada no final da noite desse domingo, 08, em Atlanta nos Estados Unidos. Ao ser questionada pelo apresentador Steven Harvey, a relações-públicas disse que gostaria de ver a sua belezaContinue reading “‘Uma mulher com minha pele não era considerada bonita e isso acaba hoje’, diz Miss Universo 2019”

Um jovem perdeu o controle de seu veículo Troller XLT, de placas PMN 1009, enquanto trafegava na Avenida Humberto Sena, nas proximidades da Escola Estadual de Educação Profissional Dr. José Alves da Silveira, no bairro Edmilson Correia de Vasconcelos, em Quixeramobim. Segundo apurado, o caso foi registrado na manhã de hoje, 09, e após perderContinue reading “Quixeramobim: Motorista perde controle de carro e atinge dois postes”

O boletim policial deste último final de semana, em Quixeramobim, apontou a ocorrência de dois casos neste domingo, 08. Por volta das 11h30min, uma equipe do Raio se desloucou ao Alto da Betânia, após receber informação de que um indivíduo estava traficando. O mesmo foi abordado e com ele encontrado 129 trouxas de cocaína,  umContinue reading “Furto de materiais de construção e prisão por tráfico de drogas movimentam o plantão do final de semana”